Se exige el mínimo de 15 créditos para la culminación de la Maestría o del Doctorado en el PPGCF. Los alumnos del Doctorado deben someterse a un examen de calificación en hasta 24 meses después de su ingreso al programa. La comisión examinadora evalúa el desenvolvimiento del proyecto, la adecuación de las interpretaciones, la perspectiva de conclusión en el plazo de 48 meses, así como de publicación de los resultados en periódicos científicos calificados.
Al final de la Maestría, los alumnos elaboran una tesis que se presenta en sesión de defensa pública a un jurado compuesto por un mínimo de tres examinadores, entre los cuales se encuentra el asesor. Al final del Doctorado, los alumnos elaboran uma tesis que se presenta en sesión de defensa pública a un jurado compuesto por un mínimo de cinco examinadores, entre los cuales se encuentra el asesor.
A continuación se listan las asignaturas ofrecidas regularmente en el PPGCF, con su respectivas cargas horarias semestrales y clasificación obligatoria (OB) u optativa (OP) en el Programa. Las asignaturas que no presentan regularidad de oferta definida se ofrecen como Tópicos en Ciencias Farmacéuticas I (15 horas), II (30 horas) ó III (45 horas).