A Congregação é o órgão de deliberação superior da Faculdade de Farmácia, responsável por supervisionar as políticas de ensino, pesquisa, extensão e administração. Cujas responsabilidades inclui:
- Elaborar e aprovar resoluções que regulem o funcionamento acadêmico e administrativo da Fafar, em consonância com as normas da UFMG;
- Deliberar sobre afastamento de docentes e de servidores técnicos e administrativos para fins de aperfeiçoamento ou prestação de cooperação técnica;
- Compor comissões examinadoras de concursos para provimento de cargos ou empregos de professor;
- Organizar o processo eleitoral, bem como definir lista tríplice de docentes para nomeação do Diretor e do Vice-Diretor da Fafar;
- Eleger os representantes da Fafar no Conselho Universitário e no Conselho de Ensino, Pesquisa e Extensão;
- Supervisionar as atividades dos Departamentos;
- Praticar os atos de sua alçada relativos ao regime disciplinar;
- Julgar os recursos que lhe forem interpostos.